《生物信息学》考试大纲

　　一、 基本要求

　　掌握生物信息学常用数据库和使用方法;掌握序列比对方法和主要比对软件使用方法;掌握DNA序列和蛋白质序列特征分析和常用序列分析软件包使用方法;掌握分子进化理论和常用分析方法;掌握基因功能注释方法和常用软件使用方法;掌握基因表达数据分析方法和常用分析软件使用方法。

　　二、 考试范围

　　1. 课程相关知识

　　基本要求：掌握生物信息学的定义、基本概念和发展;掌握生物信息学研究的基本内容、基本原理和生物学基础;了解计算机在生物研究中的应用;了解生物信息学发展史、开发与产业化。

　　1.生物信息学数据库

　　(1)知识点1：NCBI数据库的介绍

　　(2)知识点2：Swiss-Prot数据库

　　(3)知识点3：PDB数据库

　　基本要求： 掌握NCBI数据库的建设和使用方法;掌握Swiss-Prot和PDB数据库的使用方法。

　　2.序列比对

　　(1)知识点1：双重序列比对分析

　　(2)知识点2：多序列比对分析

　　(3)知识点3：BLAST数据库搜索

　　基本要求：掌握序列比对的原理和方法;掌握如何使用BLAST软件进行数据库搜索和同源性分析。

　　3.序列特征分析

　　(1)知识点1：DNA序列特征分析

　　(2)知识点2：蛋白质序列特征分析

　　基本要求：掌握基因预测的原理和方法;掌握启动子区域预测和分析的原理和方法;掌握蛋白质序列跨膜区分析的原理和方法。

　　4.分子进化分析

　　(1)知识点1：系统发育树的概念

　　(2)知识点2：分子进化理论

　　(3)知识点3：系统发育树的构建

　　基本要求：掌握系统发育树的概念;掌握DNA和蛋白质序列适应性进化的分子理论;掌握系统发育树构建的原理和方法。

　　5. 基因功能注释

　　(1)知识点1：基因功能的基本概念

　　(2)知识点2：基因功能的注释原理和方法

　　基本要求：掌握基因注释和功能分类的基本概念;掌握基因功能注释的原理和方法;掌握常用基因功能注释软件的使用;

　　6.基因表达数据分析

　　(1)知识点1：基因表达数据获取的生物学技术平台

　　(2)知识点2：基因表达数据分析

　　基本要求：掌握基因表达技术的主要生物学平台;掌握基因表达数据的主要分析方法和原理;掌握基因表达数据分析常用软件的使用。

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